外寸法、内部構造、素材、メカ、回路などほとんどＣＤ１と同じである。ＣＤ2用に新しい構造や素材を考えたりすればかえってコストアップにつながる。といってもＣＤ1と全く同じというわけでは決してない。仕上げは上部のウッドブロックがウオルナットのつや消しでぐっと渋くなった。ＣＤ1がピカピカしすぎていやだという人にはＣＤ2の方がいいかもしれない。実測重量はレッグベースこみでＣＤ1は24.1kg。ＣＤ2が23.2kg。違いを上から調べていくと、硬質のガラスのリッド（カバー）がＣＤ1は10mm厚、ＣＤ2は８mm厚と２mm薄くなった。ディスク・クランプはＣＤ1が80φ、真ちゅうの空飛ぶ円盤型（スカート付き）で170ｇだったのに対して、ＣＤ2はφ42、鉄製、スカートなしのシンプルな形に変わった。キャビネット４隅の６角鉄柱の下につながるピンポイント・レッグはＣＤ1がφ60mm、ＣＤ2がφ30。これを受けるベースはＣＤ1がアルミ鍛造で、ＣＤ2は底が鉄とフェルト、、それをゴムとプラスチックで囲むという独特の形でダンプ効果を持たせている。どちらもベースを外してピンポイント（スパイクのようにとがってはいない）接地で使うことはできる。回路面ではバランスアウトが省略されたのが大きな違い。ツインＤＡＣ以降、＋信号、−信号独立して処理していたのを、−信号側の回路を取り除いた。これはアンバランス出力（ピンジャック）で使う場合にはむしろ有利である。電源トランスは全く同じ、オーディオ部のフィルターコンデンサーのみ、12000μＦ×４から、6800μＦ×４と変更されたが、これは電力を食うＡ級出力段がバランス廃止で半分になったためと説明されている。その他の使用パーツは変更なし、ＡＣコードもヤマハ独特のφ10キャブタイヤコードでこれはヤマハの高級機に共通して使われているもの。
これでＣＤ1と音が違うのだろうか。実はかなり違うのである。音作りの担当者も、音決めに使われたスピーカーも違うということだ。ＣＤ1は驚くほどの解像度、透明度、切れ味を持ち、ソリッドな音像、広大な３次元空間を再現したが、どちらかというとハードでクールなタイプ。また高能率、ハイスピード、高分解能、ワイドレンジスピーカーでないと真価を発揮しにくい感じがあった。ＣＤ2はもう少しソフトだが、温かみがあり、人間的な親しみやすいサウンドになっている。ＣＤ1は宇宙人かもしれない。方舟のシステムにはＣＤ１の方がマッチングがいいが、一般向きとしてはＣＤ2の方が無難だ。この価格ではウルトラヘビー級、ハイＣＰ機である。